心脏肿瘤是北京协和医院心外科的特色罕见病种，包括心脏原发肉瘤、累及心脏的下腔静脉平滑肌瘤病、心脏副神经节瘤等。

心脏原发肉瘤是非常罕见且预后极差的恶性肿瘤，北京协和医院心外科常规开展以外科治疗为主的综合治疗。拥有全世界最大的年手术量，已发表多篇相关领域的临床研究论文。目前协同天津泰达国际心血管病医院、北京大学肿瘤医院等多个中心开展临床转化研究，有望在心脏血管肉瘤的分子分型和肿瘤精准治疗领域取得突破，指导药物治疗方案，并进一步改善预后。

下腔静脉平滑肌瘤病是困扰育龄期女性的罕见疾病，多为良性。北京协和医院心外科常年收治全国各地转诊的此类病例，且于2024年受邀赴粤救治静脉内平滑肌瘤病患者，获钟南山院士高度评价，同时心外科团队建立IVL规范诊疗体系（PUMCH分期+分型），实现术前精准评估、术中多学科协作（TEE指导）、术后标准化管理，荣获医院“医疗科研成果攻坚克难组二等奖”，以最小的手术创伤，结合术后内分泌治疗，提高该罕见肿瘤的临床治愈率。

心脏副神经节瘤是罕见的神经内分泌肿瘤，常导致继发性高血压。北京协和医院心外科联合内分泌科，拥有着全世界最大的心脏副神经节瘤手术数据库。擅长功能性心脏副神经节瘤的术前准备、术中术后血压管理，将该罕见复杂神经内分泌肿瘤的手术风险降至最低。