北京协和医学院康复医学与理疗学系成立于2012年，设有主任一名张福泉教授，副主任一名陈丽霞教授，由物理医学康复科与放疗科两科组建而成，取两科应用物理技术治疗病患的共同点，侧重物理技术的教学及临床应用。虽建系时间短，但组建科室历史悠久，均从建院初即有延续至今。从建科起至今一直保留着老协和“医、教、研”一体化发展的传统，建系后更是与时俱进不断壮大、创新，使教学工作更加系统、细致。

北京协和医院物理医学康复科是国内最早引入澳大利亚手法治疗脑卒中的科室，早在1986年即开设继续教育班授学；2003年起率先在国内开展血友病骨关节并发症康复评定与物理治疗，开辟了新的专业特色，2010年成为世界血友病联盟授权认可的、国内唯一的物理治疗培训中心。同时在颈椎/腰椎疾病康复治疗、特发性脊柱侧凸运动训练等方面也处于国内领先。

北京协和医院放疗科是国内率先开展宫颈癌调强放疗及三维腔内放疗的科室，其妇科肿瘤放疗及放疗全流程质控管理的临床、科研已达国际领先、国内一流水平，因此成立了“北京近距离放射治疗技术培训中心”，并被评为“北京市质控中心”，开展了包括短期技术培训及国家级继续教育培训班，开设特色课程，编写相关教材、著作，购买研发教学模具的多方面的教学工作。

康复医学与理疗学系共有骨干师资20人，其中博导1名、硕导2名，教学梯队完善，常年承担以下教学工作：

医大八年制本科生教学：

物理医学与康复医学：18学时/年

常规教学及继续教育项目：

血友病关节健康评估培训班（国家级继续教育项目）

脊柱侧凸训练方法SEAS课程（国家级继续教育项目）

宫颈癌精确放疗规范化推荐（国家级继续教育项目）

放射治疗质量控制培训班（国家级继续教育项目）

北京市区级继续教育项目CME II类10分

放疗科青年沙龙（每周四晚）

放疗科技术类实习生课程（每年9月开课，周六上午）

放疗科妇科肿瘤放疗课程

新技术培训

近5年康复医学与理疗学系科研教学取得累累硕果，共发表SCI及核心期刊文章76篇，其中教学文章1篇；获各类基金6项经费共计1145万元；获国家技术专利9项，参编教材4本。学系重视人才培养，先后7人通过院“百人计划”赴美国进修学习，3人通过CTSI科研训练课程，多人获“院优秀教师”称号。